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前沿的政策

开放获取和版权

《前沿》杂志2012年7月起的所有文章均在创作共用协议下公开发表CC-BY许可证(当前版本为CC-BY,版本4.0)。这意味着作者保留版权,但内容可自由下载、分发,并可用于商业或非商业目的,并对原始文章进行适当的归类。

在提交时,作者授予Frontiers发布许可,包括显示、存储、复制和重用内容。CC-BY创作共用署名许可允许任何人自由使用出版物,给予作者适当的署名,并引用Frontiers作为原始出版商。CC-BY创作共用署名许可不适用于显示版权声明禁止复制的第三方材料。除非第三方内容也受CC-BY创作共用署名许可或同等许可许可的约束,否则作者必须遵守任何第三方版权声明。

注册与前沿

所有投稿作者必须注册在投稿前先和《前沿》杂志联系。您必须登录您的个人前沿帐户提交一篇文章。

对于任何合著者,谁想要他们的名字在文章摘要页和PDF链接到前沿的个人资料循环网络,请注册在论文最终发表之前。

作者身份和作者责任

《前沿》遵循国际医学期刊编辑委员会(ICMJE)的指导方针其中规定,为了有资格成为一篇稿件的作者,应遵守以下标准:

  • 对作品的构思或设计有重大贡献;或工作中数据的获取、分析或解释

  • 对重要的知识内容进行严格的起草或修改

  • 为内容的发布提供批准

  • 同意对工作的所有方面负责,确保与工作任何部分的准确性或完整性有关的问题得到适当调查和解决。

不符合这些标准的贡献者,但仍然为最终稿件提供了重要的贡献,应该包括在确认部分。作者有责任获得致谢部分所列人员的书面批准。

由商业实体(假纸工厂,“造纸厂”)代表被列为作者的研究人员编写和撰写的稿件不符合《前沿》的政策,不会被考虑发表。在同行评议之前,前沿杂志将采取积极的行动拒绝可疑稿件。

作者的贡献

为了给所有作者提供适当的荣誉,并为已发表的工作分配责任和责任,个人的贡献应该在作者贡献声明中指定。作者贡献声明是强制性的。它应该代表所有的作者,并在提交时包括在内。它可以长达几句话,并且应该简要描述单个作者的任务。请只列出每个作者的两个首字母,不要用句号,但要用逗号分隔(例如JC, JS)。如果两个作者的首字母相同,请使用中间的首字母来区分他们(例如REW, RSW)或姓氏的第二个字母(例如RWe, RWa)。请看这里的例子:

AB、CZD和EF对研究的概念和设计做出了贡献。AB组织数据库。CYD进行统计分析。EF撰写了手稿的初稿。GH, IJ, AB和EF写了部分手稿。所有作者都参与了稿件修改、阅读并批准了提交的版本。”

相应的作者

通讯作者在投稿过程中,在同行评议过程中,以及在发表过程中,主要负责与期刊和编辑部的沟通。通讯作者还负责确保提交的论文符合所有期刊要求,包括但不限于作者身份的细节、研究伦理和伦理批准、临床试验注册文件和利益冲突声明。通讯作者也应该在出版后回复任何查询或批评。

作者名单提交后,如需修改,请使用作者改变形式

研究完整性:如何重用文本

提交给《前沿》的材料必须遵守以下政策,以确保学术工作的道德出版。

原创内容和复制出版物
边疆只发布原创内容。作者确认提交的原创内容在条款和条件在提交。提交给《前沿》杂志的稿件必须从未在其他地方出版过或正在考虑在其他地方出版,无论是全部还是部分。如果一篇文章之前已经在其他地方提交发表,《前沿》杂志将只考虑在文章提交时被其他出版商明确拒绝的情况下发表。

制造和伪造
Frontiers既反对伪造数据或图像(即伪造或编造数据),也反对伪造数据或图像(即故意歪曲或欺骗性操纵数据)。

冗余的出版
《前沿》杂志认为,基于同一实验或研究而提交和发表非常相似的文章是不道德的。

剽窃
当作者试图将之前发表的作品作为原创内容呈现时,就会发生剽窃。提交给《前沿》杂志的每一篇稿件都由软件CrossCheck进行文本重叠筛选,该软件由iThenticate提供支持。发现文本重叠的稿件不被《前沿》杂志考虑发表。有关抄袭的更多细节,请参阅下面的“抄袭和复制”。

我们保留与没有按照良好的研究和出版实践行事的作者的附属机构联系的权利。

抄袭和重复

《前沿》杂志会检查所有提交的稿件是否抄袭和复制,并只发表原创内容。那些被证明存在抄袭或复制的稿件将不被考虑在前沿期刊发表。所有提交的内容都必须包含以前没有发表过的内容。按照应对指南在美国,我们希望“其他研究人员直接从出版物中提取的原始措辞应该出现在引号中,并加上适当的引文。”这一条件也适用于作者自己的作品。

论文和学位论文

Frontiers允许收录作者论文中首次出现的内容,只要这是作者论文出现的唯一形式,符合作者的大学政策,并且可以在线访问。如果论文没有在线存档,则被认为是原始的、未发表的数据,并受某些文章类型的未发表数据限制。包括论文或学位论文的材料应在稿件的致谢部分注明而且在参考书目中相应引用。关于一些例子,请查看我们的“参考资料”部分作者指导方针

会议、论文集和摘要

首次作为会议论文出现的手稿如果要被认为是原创作品,就必须在其基础上加以扩充。作者需要以新的原材料(实验、数据)或对旧数据集的新处理的形式添加大量的原创内容,从而导致原始的讨论和/或结论,提供明显超过原始会议版本的价值。根据经验,至少30%的内容必须是原创的。提交此类作品的作者必须:

  • 如果作者不拥有版权,请寻求允许重新使用已发表的会议论文(许可证明应作为补充材料提交或发送至editorial.office@frontiersin.org投稿时请附上稿件ID)

  • 在致谢部分或参考文献部分引用会议。

博客

尽管允许,扩展的稿件内容之前出现在网上非学术媒体,如博客,应在投稿时在稿件的致谢部分声明。

预印本

我们支持的预印本政策鼓励在研究论文的所有阶段完全开放访问,以共享和生成研究人员支持其工作所需的知识。发表在Frontiers期刊上的作者可以在提交给同行评议期刊之前,以及在Frontiers评审过程中,在存储库或预印本服务器(如arXiv, PeerJ Preprints, OSF和其他)上分享他们的工作,前提是服务器不对作者的完全版权和重用权施加限制。同时请注意,在评审过程中,任何投稿至Frontiers期刊后共享的稿件文件都不能包含Frontiers的标志或品牌。

在提交稿件时,必须将存储库或预印本服务器中原始来源的正确归属包含在稿件中,如果在评审过程中沉积,则必须在重新提交稿件时添加。我们要求预印本在确认部分中列出,并在参考文献列表中包含完整的引用。

如果文章已经发表,那么强烈鼓励作者从预印本服务器链接到Frontiers出版物,以便读者查找、访问和引用同行评审的最终版本。请注意,我们不能考虑在科学期刊、书籍或类似实体中已经发表过或已经在审查的内容作为出版物。

翻译

我们接受原稿提交,是准确的翻译以前发表的工作。这一点应在投稿时在稿件中明确说明。需要寻求原出版商和作者的许可,并在稿件中注明。相关文件应作为补充材料,供编辑和编辑部核实。翻译稿件时应明确参考原文。

示例:“这是[语言]语言翻译/转载的[原文标题]最初发表在[出版物名称]。【名称】在【资金来源(如有)】的支持下编写了本译文。授权方是[姓名]。”

请注意,如果有任何重叠或可能冗余的担忧,前沿杂志可能要求相关出版物的副本。

修正

《前沿》杂志认识到我们有责任纠正以前发表的文章中与科学相关的错误。如符合下列条件,可提交更正:

  • 在其他方面可靠的出版物的一小部分被证明是误导性的或

  • 有一个错误的数字,不改变结论或

  • 统计数据有错误,不改变结论或

  • 有标签错误的数字或

  • 或提供了错误的显微镜切片

  • 作者/贡献者列表是不正确的,当一个值得的作者被省略或一些不符合作者标准的人被包括在内。

必须通过我们的2022世界杯预选赛 (检查我们的帮助中心关于如何提交更正的详细说明),建议使用这些Word和LaTeX模板.外勤说明的供稿应用于明确说明修改的理由,提交材料的标题应采用以下格式:“勘误:[原文标题]。”

如果错误是在发布过程中引入的,应该与Frontiers生产办公室联系。

撤稿

作为出版道德委员会委员(应对),在可能撤回的情况下,《前沿》遵守他们的指导方针和建议。

《前沿》还遵循COPE建议的其他两个关键原则:

  • 撤稿不是为了惩罚作者

  • 撤稿声明应公开,并与原撤稿文章链接。

所有可能的撤稿将根据其本身的价值进行判断,并将进行内部调查,或在令人满意的情况下,根据对作者的机构调查提出的建议。《前沿》杂志认为以下原因值得关注并可能撤回:

  • 明确的证据表明研究结果是不可靠的,无论是不当行为(如数据伪造)还是诚实错误(如错误计算或实验错误)的结果

  • 之前的研究结果在没有适当的出处、许可或理由的情况下发表在其他地方(即重复发表的情况)

  • 主要的剽窃

  • 报道不道德的研究,发表一篇没有必要的伦理委员会批准的文章

  • 与文章内容有关的法律问题,如诽谤内容

  • 主要的作者身份问题,如被证实或强烈怀疑代笔或出售(“礼物”)作者身份的案例

  • 带有政治动机的文章,客观性是一个严重的问题

  • 对个人或组织的攻击

  • 信仰问题(如智能设计)

  • 在没有相关科学或统计证据的情况下,发表不寻常言论的文章(如伪科学)。


如果读者想要引起编辑对可能需要撤回的已发表作品的注意,应该联系文章的作者,并写信给杂志,确保包括所有与作者的通信副本。

详情请参阅我们的意见及投诉政策在这里

伦理问题

如有任何道德问题,请与我们联络editorial.office@frontiersin.org

领土描述、地图和附属关系

边疆媒体SA对出版的领土描述、地图和作者关系保持中立。所有领土主张仅属于作者,并不代表其附属组织、出版商、编辑或审稿人。

编辑政策

的利益冲突

利益冲突可以是任何可能干扰或可能被视为干扰全面和客观的同行评审、决策或提交给Frontiers的文章的发表的内容。个人、财务和职业关系都可以被视为利益冲突。

所有的作者和编委会成员都被要求在投稿或接受编辑或审查任务时披露任何实际的和潜在的利益冲突。

前沿审查制度旨在保证最透明和客观的编辑和审查过程,由于处理编辑和审稿人的姓名在文章发表时公开,利益冲突将广泛显现。
未能声明竞争利益可能导致稿件被拒绝。如果出版后发现未披露的竞争利益,边疆出版社将根据内部政策和出版伦理委员会的指导方针采取行动。

任何可能被视为潜在利益冲突的内容都应在提交报表的过程中披露。利益冲突声明将自动生成,包含在生成的PDF文件中以供同行审阅,并包含在文章的最终发布版本中。

我应该披露什么?

作为作者,应该在提交过程中披露任何潜在的利益冲突。考虑以下问题,并确保你给出了任何积极的答案。

潜在的利益冲突:作者
您或您的机构是否曾因提交的工作的任何方面而从第三方获得报酬或服务?
您是否与可能被认为影响或看上去可能影响您提交的作品的实体有财务关系?
您是否有任何与研究相关的专利和版权,无论是未决的,已发行的,授权的,和/或正在收取的特许权使用费?
你是否有其他关系或活动,让读者觉得影响了你提交的作品,或者看起来可能影响了你的作品?

如果您在投稿过程中未能披露潜在的利益冲突,或如果有疑问,请联系前沿编辑部editorial.office@frontiersin.org与潜在冲突的细节尽快。

对于商业合作,所有作者都必须说明。我们建议使用以下模板:

  • [作者姓名]就职于[公司]。其余作者声明,该研究是在不存在任何可能被解释为潜在利益冲突的商业或金融关系的情况下进行的。

对于商业融资,必须声明出资人的角色。我们建议发表以下声明:

  • 作者声明,本研究得到了[资助人姓名]的资助。资助者参与了以下研究:【参与描述】

  • 作者声明本研究获得了来自[基金管理人姓名]的 资助 。资助者没有参与研究设计、数据收集、分析、解释、这篇文章的写作,也没有决定将其提交发表。

编辑和审稿人呢?

处理编辑和审稿人在接受任何编辑或审稿任务之前,将被要求考虑以下潜在的利益冲突。

潜在的利益冲突:编辑和审稿人
家庭
作者中是否有配偶或重要的人,同一家庭的成员,或非常亲密的私人朋友?
-
审阅编辑也不应该与处理编辑是同一家族的成员。
合作
在过去的两年内,您是否正在主持或曾与任何作者主持过前沿研究课题?
-
在过去两年内,您是否正在或是否曾与其中任何一位作者合作进行研究项目或出版?
-
在过去的5年里,您是否正在或是否曾以顾问或其他直接监督的身份与任何作者合作?
-
在过去的5年里,你是否在学生时期或以其他直接下属的身份与任何作者合作过?
-
注意:如果审稿编辑与审稿编辑有密切的专业关系,他们不应接受稿件,因为他们认为这会影响审稿的客观性。
联系
你是否与作者隶属于同一机构?如果是,这是否导致了与作者之间的互动、合作或共同利益,从而影响了您在进行评审时的公正性?
-
你现在是与任何作者有关联的委员会或部门的成员吗?
金融
你是否与任何作者有商业或专业合作关系?
-
您是否与参与这项研究或稿件准备的任何组织有经济利益或业务关系?
-
您是否在稿件内容上有任何经济利益或竞争性利益,从而可能影响您进行客观评审的能力?

资金信息披露

所有资金来源的细节必须在稿件的资助部分提供,包括资助号,如果适用。《前沿》的所有文章均在CC-BY创作共用署名许可下以开放获取方式发布。发表在Frontiers上的文章自动满足或超过许多机构和资助机构规定的开放获取要求,包括国家卫生研究院、医学研究委员会、英国研究委员会和维康信托基金。Frontiers将资助数据提交到开放资助者登记处,这是CrossRef提供的资助者识别服务,由学术出版商和资助机构合作产生。

免责声明

任何必要的免责声明必须包含在已发表的文章中,应在稿件中明确指出。

生物伦理学

所有提交给《前沿》杂志考虑的研究必须按照《前沿》杂志关于研究伦理的指南进行。按照应对《前沿》杂志保留拒绝任何编辑认为不符合高道德标准的稿件的权利,即使作者已经获得了伦理批准或不需要伦理批准。边疆鼓励作者遵循到达指南用于科学研究的设计、分析和报告。

涉及动物的研究

所有涉及受管制动物(即所有活脊椎动物和高级无脊椎动物)的研究在开始研究之前必须经过伦理委员会的审查和批准,并按照相关的机构和国家指导方针和法规进行。Frontiers遵循国际兽医编辑协会(兽医)发表研究(包括动物研究)的指引。根据美国兽医协会的规定,涉及动物和常规护理之外的干预措施的临床研究需要伦理委员会的监督。作者必须在提交系统中提供伦理批准信息,这将生成一份伦理声明,包括在提交中。生成的伦理声明将以以下格式包含在评审文件中:

“动物研究由[伦理委员会全名和所属机构]审查和批准。”

如果研究被豁免伦理批准,作者需要在生成的声明中说明豁免的原因。涉及客户拥有的动物(非商业出售的动物,如宠物或牲畜)的研究应展示最佳的兽医护理实践,并确认所有者或所有者的法定代表已给予书面知情同意。关于客户拥有的动物的研究,生成的陈述示例如下:

“该动物研究由[伦理委员会全名和所属机构]审查和批准。我们获得了动物主人的书面知情同意,让他们的动物参与这项研究。”

人道的端点

所有描述以死亡为终点的研究的手稿都将受到额外的伦理考虑。没有适当理由的稿件,《前沿》杂志保留拒收的权利。

涉及人体的研究

涉及人体的研究本应按照世界医学协会的规定进行赫尔辛基宣言.涉及人类参与者的研究必须按照相关的机构和国家指南进行,并获得适当的机构伦理委员会的事先批准和所有参与研究的人类受试者的知情书面同意,包括发表研究结果。在向《前沿》投稿时,需要确认此批准;作者必须在提交系统中提供伦理委员会信息,这将生成一份伦理声明,包括在提交中。应在提交系统中提供有关受试者(或在适当情况下,父母或监护人)同意参与的信息。边疆要求参与的同意必须是知情的和书面的,除非道德委员会放弃或根据当地法律不要求。提交系统将生成以下格式的伦理声明(该声明也将包含在出版的最终手稿版本中):

“涉及人类参与者的研究由[伦理委员会全名和所属机构]审查和批准。患者/参与者提供了参与本研究的书面知情同意。”

如果该研究被豁免伦理批准或同意程序,作者需要在生成的声明中清楚地说明原因。在伦理委员会放弃全面审查和批准的情况下,Frontiers可以要求作者出具一封伦理委员会出具的信件。

为了保护被试的匿名性,识别信息不应该出现在稿件中,除非这些信息对于科学目的是绝对必要的,并且得到了被试的明确批准。

包括可识别的人类数据

Frontiers遵循ICMJE建议关于对研究参与者的保护,其中指出,患者有隐私权,未经知情同意不应被侵犯。我们要求在所有稿件中删除非必要的可识别细节,如果对匿名性有任何怀疑,则需要书面知情同意。

研究人员和作者有责任确保这些原则得到遵守,包括在发表任何可能可识别的数据或图像时获得书面知情同意。

书面知情同意可以记录在机构或伦理委员会提供的表格上,它必须明确说明如何使用可识别数据。前沿的同意书可用于此目的,但如果另一种形式的同意符合ICMJE建议,使用。我们认为,在填写同意书之前,作者有责任鼓励需要同意发表的参与者或患者阅读和理解ICMJE指南,以供他们参考。还应鼓励参与者在签署同意书前提出任何问题,并确保他们感到舒服。

填写好的同意书应根据机构政策由作者或他们各自的机构保存。填写好的表格不应包含在您的Frontiers投稿中。但是,在审查过程中或出版后,应应编辑或编辑部的要求提供同意表格。

我们的编辑和编辑部工作人员将决定什么构成可识别数据,如果不能提供所需的同意文件,稿件可能会被拒绝。请注意,在所有病例报告文章中,如果患者或受试者已被识别或可识别,则必须获得书面知情同意才能发表。应在提交系统中提供关于参与者/患者同意发布可识别数据的信息。这将产生一份伦理声明,将直接包括在手稿中。

临床试验

世界卫生组织(WHO)国际临床试验注册平台(ICTRP)将临床试验定义为“前瞻性地将人类参与者或人类群体分配给一种或多种与健康相关的干预措施,以评估对健康结果的影响的任何研究。”根据国际医学期刊编辑委员会的临床试验注册声明(ICMJE),所有临床试验必须在参与者登记开始时或之前在公共试验登记处注册。为了满足ICMJE和Frontiers的要求,临床试验可以在任何一级注册中心注册WHO注册网络或一个国际批准注册

临床试验报告须符合报告试验综合标准(配偶),包括一个流程图,展示登记、干预措施分配、随访和每个受试者数量的数据分析,并在报告随机临床试验时考虑CONSORT核对表的项目。

临床试验注册信息(唯一标识符和URL)必须包含在摘要稿件中。

材料和数据政策

前沿科技致力于开放科学和开放数据;我们要求作者提供与稿件结论相关的所有数据。生成的数据应公开,并根据我们下面的“数据引用指南”引用。我们的目标是在数据可用性方面达到最佳的社区标准,确保提高我们发表文章的透明度和可重复性。

我们在数据可用性方面的政策是由社区驱动的标准制定的,这些标准得到了Frontiers的支持,如透明与开放(TOP)。的指导方针并由联合声明的数据引用原则所产生FORCE11

可用性的材料

作者被要求将所有用于进行研究的材料提供给其他研究人员。实验复制所需要的研究材料应在材料和方法部分明确标明。协议、分析方法和研究材料等相关材料最好上传到提供全局持久链接/标识符的在线存储库。如果这是不可能的,强烈鼓励作者在有兴趣的研究人员的要求下提供这些材料,这应该在手稿中说明。

资源标识项目

希望参加FORCE11的作者资源标识项目应在当前稿件中使用相应的目录号和研究资源标识符(RRID)引用抗体、转基因生物、软件工具、数据、数据库和服务。有关该项目以及如何搜索RRID的更多信息,请参见此处在这里

可用性的数据

《前沿》(Frontiers)要求作者让任何有资格的研究人员都能获得所描述的研究结果背后的“最小数据集”,并用于得出手稿的结论。数据应该是公平的——可查找、可访问、可互操作和可重用——以便其他研究人员能够定位和使用数据。但是,如果数据由于法律或伦理原因不能公开,则允许例外。

为了遵守他们研究领域的最佳实践,作者被要求在发表时在特定的、稳定的、社区支持的存储库中向读者提供特定类型的数据,例如下面列出的那些。鼓励作者与我们的数据可用性办公室联系datapolicy@frontiersin.org在提交之前,与任何有关数据报告的查询。

与数据可用性相关的异常

我们强烈鼓励共享最大限度的数据;然而,如果存在伦理、法律或隐私问题,则不应共享数据。如果由于法律、伦理或隐私限制,部分或全部数据不能共享,作者应在提交时在数据可用性声明中明确这些限制。
公开数据可能受到的限制包括患者保密和参与者隐私。作者应确保共享的数据符合参与者就使用机密/可识别人类数据所提供的伦理同意。我们要求作者证明这些数据的发布不会危及参与者的匿名性或违反当地的数据保护法。

在为保护机密或专有信息而限制访问的情况下,作者必须解释对数据集的限制,并应第三方的要求在获得许可的情况下提供数据。数据可用性声明应包括请求访问数据集所需的所有必要联系信息。

数据引用的指导方针

鼓励作者引用在研究中生成或分析的所有数据集。在引用数据集的地方,它们应该包含在引用列表中,以最大化未来的可用性。

应使用以下格式:
(数据)的作者的名字。(一)数据的标题。库名称。的版本。持续的标识符

数据可用性语句

所有发表在Frontiers上的文章都需要数据可用性声明。在提交过程中,作者将被要求详细说明支撑手稿中结论的原始数据的位置,以及这些数据是否会在发表后提供给其他研究人员。作者还将被要求提供在手稿中分析过的任何现有数据集的详细信息。这些数据集应根据我们的数据引用指南进行引用。

将使用提交表格中提供的信息自动生成一份声明;但是,陈述不完整或不正确的稿件将被禁止进入审查程序。

可接受语句的例子

  • 原始数据集可在一个公众可访问的存储库中获得:
    该研究的原始贡献是公开的。这些数据可以在这里找到:[链接/登录号]。

  • 现有的数据集可在一个公众可访问的存储库中获得:
    本研究分析了公开的数据集。这些数据可以在这里找到:[链接/登录号]。

  • 现有的公开可访问数据集的信息包含在文章中(例如使用超过10个登录号的研究):
    本研究中提供的数据集可以在在线存储库中找到。储存库/储存库的名称和登录编号可在文章/补充材料中找到。

  • 所有相关资料均载于文章内:
    该研究的原始贡献已包含在文章/补充材料中,进一步查询可直接向相应的作者/s。

  • 限制适用于数据集:
    由于[有效原因],本文中给出的数据集不容易获得。访问数据集的请求应定向到[文本输入]。

  • 已从第三方获取数据:
    本研究中分析的数据来自【来源】,以下许可/限制适用于【限制】。访问这些数据集的请求应发送到[NAME, EMAIL]。

  • 资料集可按要求提供:
    支持本文结论的原始数据将由作者提供,没有任何保留。

必须的数据和推荐的存储库

在发表相关的Frontiers稿件之前,作者被要求在公共的、社区支持的存储库中存放以下强制性数据类型,例如下面列出的那些。

强制数据存储库
数据类型 所需的存储库 元数据标准
遗传和基因组序列(DNA/RNA)*
基因库
日本DNA数据库(DDBJ)
欧洲核苷酸档案(ENA)
宏基因组序列
EBI宏基因组
DNA和RNA追踪或短读测序数据
NCBI跟踪存档NCBI序列
读取存档
遗传多态性数据,包括SNP和CNV数据
dbSNP
dbVar
欧洲变异存档
DGVa
基因表达数据;染色质免疫沉淀数据(深度测序或微阵列)
ArrayExpress
基因表达综合(GEO)
MIAME / MINSEQE
将基因型与表型联系起来的数据
dbGaP
蛋白质序列数据
UniProt
蛋白质组分析数据
骄傲
PeptideAtlas
ProteomeXchange
MIAPE
小分子、蛋白质、蛋白质复杂数据结构数据
晶体学开放数据库
剑桥结构数据库
wwPDB(蛋白质数据库)
电子显微镜数据库
CIF
分类数据
Zoobank

*基因序列变异应根据人类Variome计划

建议作者考虑将下面列出的数据类型存储在公共的、社区支持的存储库中。

推荐数据存储库
数据类型 推荐的存储库 元数据标准
蛋白质相互作用数据
相互作用蛋白数据库(DIP)
MIMIx
代谢物和代谢物组分析数据
MetaboLights
人类代谢组数据库
MSI
小分子筛选数据;化合物数据
PubChem
CIF
流式细胞仪数据
流库
脑成像数据;神经影像数据
OpenNeuro
英蒂
NITRC
NeuroVault(统计地图)
投标
特征数据
试数据库
物候学数据
全国物候学网络
任何数据
Figshare
森林女神数字库
没有一个

RNAseq数据的包含

使用RNASeq进行转录组学比较分析的研究必须包含至少三个生物学重复(除非另有理由)。每个生物复制都应该在一个独立的文库中表示,如果文库是多路复用测序的,那么每个生物复制都应该具有唯一的条形码。还强烈建议对研究中强调的一些关键转录本进行验证。

这些实验的全部数据必须在提交时在一个免费的可访问的资源中提供给审稿人,例如Sequence Read Archive (SRA)或欧洲核苷酸档案(ENA).根据稿件中提出的问题,转录组的从头组装也可能需要多次复制,组装的序列连同序列注释必须免费提供,如figshare德律阿得斯

包含蛋白质组学数据

作者应提供有关如何进行肽/蛋白质匹配的相关信息,包括用于处理和分析数据的方法、大规模研究的错误发现率(FDR)以及肽和蛋白质匹配的阈值或截止率。进一步的信息应包括所使用的软件、质谱仪类型、序列数据库和版本、数据库中序列的数量、处理方法、用于匹配的质量公差、可变/固定修改、允许遗漏的裂解等。

作者应提供用于识别蛋白质和/或多肽的信息作为补充材料。这应该包括登录号、观测质量(m/z)、电荷、δ质量、匹配质量、肽/蛋白质评分、肽修饰、错裂、肽序列、匹配等级、匹配物种(用于跨物种匹配)、肽匹配数量等信息。不明确的蛋白质/肽匹配应该被指出。

对于定量蛋白质组学分析,作者应提供信息来证明统计学意义,包括生物重复、统计方法、不确定度估计和用于计算误差的方法。

对于与生物学相关的翻译后修饰(PTMs)的肽匹配,以及使用单一质谱进行的任何蛋白质匹配,作者应将该信息作为原始数据或注释谱,或将数据提交到在线存储库(推荐选项;见下表)。

原始或匹配的数据和2-DE图像应提交到公共蛋白质组库,如参与ProteomeXchange的那些。投稿代码和/或数据链接应在稿件中提供。

代码

前沿科技致力于开放科学和开放数据;我们要求作者将所有用于进行研究的代码提供给其他研究人员。复制实验所需的代码应在材料和方法部分明确指出,并在可能的情况下将代码上传到在线存储库(如github.com或代码海洋),提供一个全局持久链接/标识符。

我们关于代码可用性的政策是根据社区驱动的标准制定的,这些标准是边疆所认可的,比如透明和开放(TOP)。的指导方针并由联合声明的数据引用原则所产生FORCE11

与代码可用性相关的异常

我们强烈鼓励尽可能分享原始代码。在自定义代码是专有的情况下,如果复制研究结果所需的所有相关软件都可供研究人员在商业上使用,则例外。所使用的专有软件的详细信息应列在材料和方法部分。
在提交时,作者应在利益冲突声明中声明与代码和自己有关的任何知识产权。

统计数据

《前沿》要求所有关于数量差异的陈述都应基于定量数据和统计检验。例如,如果基于western blot对某种蛋白质的丰度进行了定量说明,我们要求用正确的分析软件(如ImageJ)和统计数据对该印迹进行扫描和定量评估,以支持该说明。
统计应该/必须应用于独立的实验。独立样本的数量和偏差参数(如平均值的标准误差、标准差、置信区间)应在方法或

图的传说。一般来说,单个实验中的技术重复不被认为是独立的样本。如果采用多重比较(如微阵列数据或全基因组关联研究),任何分析都应纠正假阳性结果。统计程序的说明应包括所使用的软件和分析,并且必须足够详细,以便再现。

实验

作者被要求在他们的图例中明确说明进行了多少次实验(通常我们要求n=3作为最小值)以及进行了哪些具体的统计分析。

图像处理

边疆对图像处理的关注是非常严肃的。我们不接受图像中的个别特征被修改(包括增强、遮蔽、移动、回收、删除或添加)。图像处理方法(如改变亮度、对比度或色彩平衡)必须应用于图像中的每个像素,这些改变不应改变图中所示的信息。裁剪图像应该避免在可能的情况下凝胶和污点。如果以图形显示裁剪图像,则必须将整个原始凝胶的完整扫描作为补充材料的一部分提交。如果为了说明目的而重用控件图像,则必须在图图例中明确声明。如果任何形式的图像处理合法地需要解释数据,软件和增强技术必须在稿件的方法部分声明。图片分组和拼接必须在稿件和图文中明确说明。

我们的人工智能审查助手(AIRA)经过训练,可以检测特定类型的回收、修改和操作。任何对未公开的图像修改提出的担忧将被调查,并要求作者提供原始图像和数据。作者未能充分解决这些问题将导致稿件被拒绝,这个问题可能会被提交给作者所在的机构。

支持

在我们持续改进用户体验和支持研究社区的承诺中,我们欢迎您的反馈、问题和建议。请访问我们的帮助中心如欲在我们的平台上找到指导,或与我们联系support@frontiersin.org